灰指甲常是由真菌感染而发生的，预防灰指甲就是要预防甲真菌的滋生。日常生活要注意手足的清洁干燥，脚趾缝不宜保持干燥，容易滋生真菌，感染趾甲，每天洗脚时应逐一搓洗脚趾缝，清除脚趾缝中的死皮和脏泥，洗脚后要用专用毛巾擦干双脚，注意拭干脚趾缝，不要任其自然风干。
鞋袜每日与脚密切接触，容易吸收脚部的汗液，潮湿的鞋袜容易滋生真菌，感染趾甲。因此，鞋袜必须做好清洁、干燥处理。选择袜子时，应选用透气性、吸水性较好的全棉袜，每日更换清洗，清洗袜子时尽量用沸水烫洗。鞋子应选择透气性好的，下雨天要穿胶鞋，保持鞋子内部的干燥。平时鞋子应勤换，换下来的鞋子应在阳光下或通风处晾晒，可以起到杀菌消毒的作用。有些人用消毒水喷洒鞋袜或撒脚气粉，这样可能会损害脚部皮肤，不建议长期使用。
灰指甲常与手足癣共同存在，互相影响。手足癣患者只要指甲受到外伤或微小挫伤，真菌就会乘虚而入，感染甲组织。而手足癣治愈后仍会受到灰指甲的真菌感染，导致疾病复发，因此，灰指甲和手足癣要一同治疗。
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